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しょうが無いので、Zend_DB_Selectを修正。

<?php
    // before
    public function where($cond, $value = null, $type = null)
    {
        $this->_parts[self::WHERE][] = $this->_where($cond, $value, $type, true);
        return $this;
    }


    // after
    public function where($cond, $value = null, $type = null)
    {
        // if $cond is null then ignore.
        if ((is_null($cond) || ($cond == '')) == false) {
            $this->_parts[self::WHERE][] = $this->_where($cond, $value, $type, true);
        }
        return $this;
    }
    
    public function orWhere($cond, $value = null, $type = null)
    {
        // if $cond is null then ignore.
        if ((is_null($cond) || ($cond == '')) == false) {
            $this->_parts[self::WHERE][] = $this->_where($cond, $value, $type, false);
        }
        return $this;
    }

これでwhere()やorWhere()にnullか空白文字列渡しても無視してくれるようになったので、SqlHelperのmakeWhere()も一応、空白を返す場合はnullにするように変更。

<?php
    public function makeWhere()
    {
        if (count($this->_whereArray) == 0) {
            return null;
        }

        $res = null;
        foreach ($this->_whereArray as $item) {
            if ($res == null) {
                $res = '(' . $item['value'] . ')';
            } else {
                $res = $res . ' ' . $item['cond'] . ' (' . $item['value'] . ')';
            }
        }
        return $res;
    }

    // ついでに、makeWhereの結果は自分自身にも渡されるので、こっちでもnullと空白を無視
    public function addOr($value)
    {
        if((is_null($value) || ($value == '')) == false) {
            $this->_whereArray[] = array('cond' => 'or', 'value' => $value);
        }
    }

    public function addAnd($value)
    {
        if((is_null($value) || ($value == '')) == false) {
            $this->_whereArray[] = array('cond' => 'and', 'value' => $value);
        }
    }

これで無事(?)、気兼ねなく条件分岐なしで呼び出し可能になりましたよと。

あ、戻り値の$resを()でくくらないのは、where()に渡そうがaddOr()/addAnd()に渡そうがその中で必ずくくられるからです。
別に多重にくくっても問題は無いですが、生成されたSQL文を見ると括弧が冗長すぎて気持ち悪くなるですよ‥‥