Excel2010だと既にExcelインスタンスがある場合にファイルを開くと同じMDI親フォームの下で開くのがどうにも耐えられない、という一点で結局、Office 2013を入れ直しです。
同じインスタンスなんだけど別ウィンドウで開く動作になれると、同一ウインドウで開くか別インスタンスで開くかの二択はありえないという感じですよ。
全ファイルを無理矢理別インスタンスで開く様に関連づけを弄ったりしましたが、別インスタンスだとワークブック間でのコピペがまともに動かないのでやっぱり細かいところで使えないわん。